Abritant quatre espèces aquatiques remarquables, le bassin de l’Airou a été classé Natura 2000. Initié par l’Union Européenne en 1992, Natura 2000 est un réseau de sites européens. L’objectif est de garantir un état de conservation favorables aux habitats naturels et aux espèces d’intérêt communautaires. Il en existe plus de 1750 en France. Depuis 2007, le Syndicat Intercommunal d’Aménagement et d’Entretien de la Sienne (SIAES) est chargé d’animer le site du bassin de l’Airou.
Ses principales actions ont été, par exemple, la mise en place d’un programme de restauration et d’entretien de l’Airou et de ses affluents, des mesures agro-environnementales (subventions agricoles pour les exploitants qui gèrent leurs parcelles de façon plus extensives) et la déclinaison régionale du Plan National d’Action en faveur de la Mulette Perlière.